La USB cuenta con un conjunto de Institutos y Centros que se encargan de promover trabajos de investigación, auspiciar encuentros académicos, estimular a los profesores y estudiantes con centros e instituto afines, así como mantener vinculación con entes relacionados.
Institutos
- Instituto de Altos Estudios de América Latina-IAEAL
- Instituto de Desarrollo Tecnológico e Innovación IDT+i USB
- Instituto de Tecnología y Ciencias Marinas- INTECMAR
- Instituto de Estudios Regionales y Urbanos- IERU
- Instituto de Energía -INDENE
- Instituto de Investigaciones Históricas de la USB- BOLIVARIUM
- Instituto de Recursos Naturales -IRN
Centros
- Centro de Estadística y Software Matemático- CESMA
- Centro de Ingeniería de Superficies e Interfaces -CISI
- Centro de Adiestramiento y Desarrollo Tecnológico Petrolero
- Centro de Investigación en Gravedad y Altas Energías -CIGAE
- Centro de Interpretación de Datos Sísmicos-CPDS
- Centro Iglu Caribe
